Автономная Церковь - поместная Церковь, имеющая независимость в вопросах внутреннего управления, предоставляемую той или иной автокефальной Церковью, в состав которой данная Церковь входила ранее на правах экзархата или епархии.
Глава автономной Церкви избирается на Поместном Соборе с последующим утверждением патриархом автокефальной Церкви.
В настоящее время существуют следующие автономные православные Церкви:
- Синайская (юрисдикция Иерусалимского Патриархата),
- Финляндская (юрисдикция Константинопольского Патриархата)
- Критская (юрисдикция Константинопольского Патриархата)
- Японская (с 1970 года в юрисдикции Московского Патриархата).
- Украинская (в юрисдикции Московского Патриархата).
- Китайская (в юрисдикции Московского Патриархата) - деятельность церкви фактически парализована в силу сложных исторических судеб и позиции современных китайских властей.